代わりのナハN36編成は2月13日に大宮総合車両センターから中原電車区へ回送され、3月15日から運用を開始しています。これによって、南武線本線は全編成がE233系で統一されました。
4月10日に中原電車区に返却された後に4月12日に幕張車両センターに回送され、4月13日付で幕張車両センターに転属しました。在来の普通列車用マリC6**編成とは別にマリJ1編成としてサイクルトレイン「B.B.BASE」に改造され、2018年１月6日から運用を開始しています。
◎動向
・2017/2/9 最終運用（03F）
・2017/2/10 中原電車区（武蔵中原）から茅ヶ崎運輸区（茅ヶ崎）へ回送。
・2017/4/10 茅ヶ崎運輸区（茅ヶ崎）から中原電車区（武蔵中原）へ回送。
・2017/4/12 中原電車区（武蔵中原）から幕張車両センター（津田沼）へ回送。
・書類上の転属日 2017/4/13
この日の03F運用が、ナハ53編成および南武線209系の最終運用でした。（稲城長沼) （拡大）
205系などと同様に運用離脱後は茅ヶ崎に疎開されていました。（2017.4) （拡大）
（2017.4) （拡大）
東京メトロ16000系の甲種輸送が横を通過。（2017.2.11) （拡大）
2016年1月〜2017年2月は、E233系35本以外は209系ナハ53編成1本のみとなっていましたが、以前に103系ナハ22編成1本のみが残った時のような、平日朝のみの限定運用とはならず、E233系と同様に通常の運用に入っていました。
早朝の多摩川橋梁を走行するナハ53編成。（2017.2) （拡大）
雪の中、快速運転に入ったナハ53編成。（2016.11 府中本町-立川) （拡大）
E233系の導入前も209系は36本中4本の少数派でしたが、最後の1年間は36本中1本になっていました。（2017.1 中原電車区) （拡大）
